Los análisis genómicos facilitan tener una idea de la carga antigénica de cada tumor

El Vall d´Hebron Instituto de Oncología (VHIO) ha reforzado su modelo integral de investigación en cáncer con nuevos grupos de investigación. Uno de ellos es el Grupo de Inmunogenómica Computacional, dirigido por Francisco Martínez Jiménez , que aplica métodos computacionales y de secuenciación genómica para identificar alteraciones en tumores primarios y metástasis que influyen en la heterogeneidad tumoral, así como los mecanismos por los que las células cancerosas evaden la vigilancia del sistema inmune. Mantiene además una estrecha colaboración con la Hartwig Medical Foundation, una de las mayores organizaciones a nivel mundial comprometida con la oncología genómica de precisión.

En él, trabajan para entender la base genómica de la oncogénesis y el modo en que interactúa con el sistema inmunitario. " Nuestro tipo de trabajo es con ordenadores, por decirlo de una manera sencilla ", afirma Martínez. Utilizan datos de pacientes cuyos tumores han sido secuenciados, tras la biopsia. " Lo que intentamos, por un lado, es detectar cuáles son las claves genómicas de cada uno de los tumores, lo que determinan las alteraciones conductoras de los tumores. Por otro lado, cómo el tumor, a lo largo de su evolución en distintos estadios, tanto el primario como cuando metastatiza a otra localización, interacciona con el sistema inmune ", explica. Lo estudian a través de los datos genómicos de los pacientes y de las biopsias de los tumores. " Este tipo de información nos puede dar si ha habido alteraciones en los tumores que, de alguna manera, impiden su reconocimiento por parte del sistema inmune ", indica. Es algo que han observado con bastante frecuencia en su laboratorio: " Aproximadamente, uno de cada cuatro pacientes tiene alteraciones que se llaman de escape en el sistema inmunitario ".

Asimismo, estos análisis genómicos facilitan tener una idea de lo que se llama la carga antigénica de cada tumor. " Es, digamos, una estimación de cuáles son las alteraciones que son expuestas por el tumor al sistema inmune o que son más susceptibles de se r expuestas al sistema inmune ", aclara. Este Grupo de Inmunogenómica Computacional está asociado a la mayor base de datos de pacientes con cáncer metastásico cuyo genoma ha sido secuenciado y analizado por la Hartwig Medical Foundation. " Estamos hablando de más de 7.000 tumores para los que hemos hecho una secuenciación de todo su genoma y que utilizamos para base de la mayoría de nuestros análisis ", concreta.

Gracias a esto, se " puede ayudar " a llegar a una medicina más personalizada. " La medicina personalizada no sólo es cuestión de un tipo de investigación, sino que ha de ser a través de la colaboración o la interacción de distintos campos y de distintos profesionales. Desde luego, lo que es el análisis preciso de cada tumor para identificación de cuáles son las alteraciones específicas conductoras y cuál es su relevancia, también en su interacción con el sistema inmune, es el primer paso que es absolutamente necesario ", piensa. Añade que, después, " hay que encontrar los tratamientos, que sean específicos para cada uno de los pacientes ".

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Los análisis genómicos facilitan tener una idea de la carga antigénica de cada tumor

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